Você pode carregar adições ao seu ~/.vimperatorrc com
:source ~/.vimperatorrc
Note que se você removeu alguma configuração do seu arquivo de configuração, depois de obter o novo arquivo, as configurações da opção antiga ainda estarão no lugar se não forem sobrescritas com alguma nova configuração, pois :source apenas executa o arquivo de configuração como se você os digitaria no prompt.