Observe que essas unidades geralmente são mais lentas do que suas contrapartes internas (elas usam unidades que não são necessariamente feitas para desempenho), especialmente devido às velocidades de transferência mais lentas no USB.
Mesmo que o disco rígido esteja criptografado, você poderá usar o software de partição para limpar a unidade e reformatá-la como uma partição ext ou FAT, o que preferir para o sistema operacional desejado. Para todos os efeitos, a unidade retirada da unidade externa é a mesma, mas possivelmente a unidade de disco rígido mais barata / mais lenta que a unidade interna existente.
O uso do software de partição permite tratar essa unidade como um meio de armazenamento bruto. Apesar das partições originais ou possível criptografia na unidade. Apenas limpe e reformate-o. Você deve ser capaz de fazer isso no processo de instalação do seu sistema operacional Linux.
O pior cenário é que você não tem os drivers corretos para o disco rígido. Isso geralmente não é um problema, a menos que você tenha um controlador SATA ou RAID separado. Se é o seu laptop, não deve ser o caso.