Há muito mais na inicialização de um sistema operacional do que simplesmente ter um monte de arquivos no disco. Há um grupo reservado de blocos no início do disco que contém algumas instruções especiais de inicialização que informam ao computador como inicializar.
Se o seu disco rígido antigo ainda não está morto ... Eu recomendo que você veja uma ferramenta como o clonezilla ou o Symantec Ghost para clonar seu disco rígido. Ele irá copiar corretamente os bits especiais da unidade que são necessários para inicializar, bem como redimensionar o volume para preencher todo o disco.