Para uma solução rápida e suja, encontrei o link
Seguido o comentário de rd2020 para o AutoHotkey (já que eu já estou usando para outras coisas)
Software AutoHotKey transferido por download No arquivo AutoHotkey.ahk, adicionou estes para não fazer nada para Cntrl + MouseWheelScrolling
#IfWinActive ahk_class Chrome_WidgetWin_1
{
^WheelDown::return
^WheelUp::return
#MaxHotkeysPerInterval 1000
}