Apenas ter o script presente em /etc/init.d
não é suficiente para que ele seja executado na inicialização.
Para adicioná-lo à sua inicialização, você deve informar ao Ubuntu sobre isso:
sudo update-rc.d css-servers defaults
Ele deve então iniciar na próxima inicialização, se o script estiver formatado corretamente, executar o bit executável, etc. Os pacotes que você instalar a partir de apt-get
/ Software Center executam este comando ou seu equivalente automaticamente, e é por isso que você geralmente tem que se preocupar com isso.
Se você quiser iniciá-lo imediatamente, pode chamá-lo diretamente:
sudo service css-servers start