Se, quando você diz encrypted system
, quer dizer que escolheu criptografar seu diretório pessoal quando configurou seu sistema, não se preocupe, você pode fazer o backup desses arquivos / pastas normalmente.
O que acontece com a criptografia colocada em seu diretório pessoal é que cada arquivo e pasta nele é copiado para um diretório criptografado que espelha seu diretório pessoal, ou seja, você teria
/home/<user>/stuff
/home/.encfs/<user>/stuff, but encrypted
onde o segundo diretório é o criptografado. Quando você faz o login, o sistema de segurança tenta descriptografar o diretório criptografado usando seu nome de usuário e senha, dando-lhe acesso às coisas. Não é criptografado enquanto você está logado, então você pode fazer o backup normalmente.
Você pode ler como o diretório pessoal criptografado funciona em esta página Wiki do Ubuntu. Especificamente, você deve verificar a seção Como funciona no meio da página e trecho que publiquei abaixo:
Encfs cria um arquivo / pasta criptografado
dentro de /home/.encfs/testuser para cada
arquivo / pasta que você cria dentro
/ home / testuser. Quando o criptografado
pasta é "montada" os arquivos são
descriptografado na mosca e acessível em
o ponto de montagem (/ home / testuser).
Com o pam_encfs configurado como está,
toda vez que um usuário tenta efetuar login,
tentará executar "encfs
/home/.enc/$USERNAME / home / $ USERNAME "
usando a senha da sua conta. Para usuários
você não configurou a criptografia para este
vai simplesmente falhar e tudo é o
mesmo que normal. Para usuários que você configurou,
a pasta vazia / home / $ USERNAME
de repente fornecer acesso ao seu
arquivos e pastas descriptografados! Yay!