Em primeiro lugar, o site da Microsoft mencionado também fornece apenas mídia de 64 bits para quem comprou o produto de varejo, não a versão instalada de OEM.
Se você quiser ir 64Bit, você precisará comprar uma nova licença, e a maneira mais barata (que eu encontrei) é comprar um disco OEM de 64 bits como esses em www.dabs.ie (.co. uk, .com) e use a chave que vem com ela ou a chave que veio com o seu sistema.
Se ele não for ativado imediatamente, ligue para o número de ativação da Microsoft - ele não o matará! Simplesmente explique que você está reinstalando com o 64bit Vista.
OBSERVAÇÃO 1: Se você quiser reutilizar a chave fornecida com o sistema, será necessário instalar a mesma versão (comercial, residencial, doméstica premium) fornecida com seu sistema.
NOTA 2: o Windows Vista Ultimate tem 32Bit e 64Bit no DVD de instalação aparente
JB