Existem arquivos e diretórios ocultos que contêm arquivos do sistema que não estão incluídos no cálculo. As informações de volume do sistema, por exemplo, contêm os pontos de restauração do sistema e as cópias de sombra do volume, entre outras coisas. Ele não está incluído no cálculo porque, por padrão, a ACL não permite que sua conta de usuário exiba a pasta ou suas propriedades. Você pode obter acesso a ele, se quiser, no entanto.
Em outra nota, o utilitário cleanmgr.exe (mais conhecido como Limpeza de disco) pode ajudá-lo a recuperar a maior parte do seu espaço em disco. A guia Mais opções permite excluir todos, exceto os pontos de restauração mais recentes e as cópias de sombra de volume.