O que eu fiz, desde que o Dropbox está realmente ficando chato, é que eu criei um arquivo ".reg" que remove todas as entradas do Dropbox:
Windows Registry Editor Version 5.00
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt01]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt02]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt03]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt04]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt05]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt06]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt07]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt08]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt09]
[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\ShellIconOverlayIdentifiers\ DropboxExt10]
Em seguida, eu corro um arquivo ".cmd" que o executa e reinicia o Windows Explorer:
regedit -s FixDropboxTortoiseSVNConflict.reg
taskkill /f /im explorer.exe
start explorer.exe
E o TortoiseSVN mostra sobreposições de ícones novamente.
Não é a maneira mais bonita de fazer as coisas, e pode exigir a alteração das chaves de registro acima quando o Dropbox as alterar novamente no futuro, mas remove algum trabalho manual de ir ao registro e renomeá-las / apagá-las, uma por uma :)