Parece ser o mesmo para mim,
o que é diferente?
command.com é o shell da linha de comandos do Windows 9x. cmd.exe é o shell da linha de comandos do Windows NT. Já que o Windows 9x está morto (hooray) você só usa cmd.exe hoje em dia, o que é uma coisa boa, porque apesar de ter muitas falhas, command.com foi muito pior!
O CMD.EXE é um processador de linha de comando para o Windows de 32 bits. Muito parecido com o MS-DOS anterior, ele fornece uma interface de usuário somente em modo de caractere na qual você pode digitar comandos para executar programas. O CMD.EXE é um programa de 32 bits que é totalmente parte do Windows - na verdade, é o que é executado quando você seleciona Prompt de Comando no menu Acessórios do Windows.
O COMMAND.COM, por outro lado, existe apenas para compatibilidade e programas de 16 bits. Existe apenas para aqueles programas que não foram atualizados desde os dias do MS-DOS. Ele foi projetado para executar aplicativos de 16 bits e opera exatamente como o antigo MS-DOS fez.
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