Sim, é possível gravar arquivos ISO a partir da linha de comando do Windows, mas somente no Windows 7 e superior.
Como gravar uma imagem a partir da linha de comando no Windows
Os arquivos de imagem ISO ou IMG podem ser gravados no Windows 7 ou 8 pela linha de comando com bastante facilidade. Primeiro, abra o Prompt de Comando e digite isoburn para obter o seguinte guia de sintaxe de opinião. Como foi observado na discussão abaixo, você não precisa referenciar o arquivo.exe, pois ele está na pasta system32.

Inicieoisoburn.exeusandooseguintecomandoeparâmetros:
Sintaxe:
isoburn.exe/q[theCD/DVDwritingdrive]Exemplo:
isoburn.exe/qD:C:\Users\JDoe\Desktop\image.isoDepois de alguns momentos, você verá:

Enquantosim,oprocessopodeseracionadoapartirdalinhadecomando,essajanelaaindapodeprecisarserfechadamanualmente.
Vejatambém:
link