Você pode usar command
para contornar a consulta normal da função bash.
command rm
Exemplo não destrutivo:
$ alias which='which -s'
$ function which { echo "which $@?" ; }
$ which which
which -s which?
$ command which which
/usr/bin/which
Como alternativa, chame-o usando env
(executando o primeiro programa com o nome dado no $PATH
ou especificando o caminho completo.
/usr/bin/env rm
/bin/rm