Você pode usar o Process Monitor , livre da Microsoft, para fazer isso. Defina o filtro dentro do Process Monitor para esta pasta e ele mostrará quando / se for acessado:
Process Monitor is an advanced monitoring tool for Windows that shows real-time file system, Registry and process/thread activity.
Se você acha que esta pasta está sendo acessada somente durante o processo de inicialização, você pode habilitar o boot logging selecionando o ponto de menu correspondente em Opções. Quando você inicializar o Windows na próxima vez, o Process Monitor registrará toda a atividade do sistema em um arquivo de log, que poderá ser revisado posteriormente. Você realmente precisará inserir um filtro restritivo, caso contrário, seu tempo de inicialização será muito longo.