Passou por isso enquanto procurava visivelmente o mesmo problema, mas não relacionado ao Samba ou a qualquer outro utilitário específico de compartilhamento de arquivos.
(Levei um pouco de trabalho no google para encontrar esta página e é por isso que estou adicionando minha nova resposta para qualquer outra pessoa que encontre isso como eu fiz)
O problema estava afetando apenas os diretórios de um único usuário (quando visto por outros) e todos os nomes de diretório mutilados estavam no formato de seis (6) caracteres maiúsculos ou números, um (1) ~ (til), seguido por um único caractere maiúsculo ou número.
Exemplos :
G2X4IA~5
O2T3KH~K
SYJ2IT~R
Solução :
O (s) usuário (s) MAC em questão deve parar de usar espaços à direita e / ou caracteres especiais em nomes de diretório. É isso aí. Quase todos os diretórios em questão tinham um espaço à direita, e o restante tinha um caractere especial à direita (um deles tinha um bom caso de teste). Simplesmente removê-los imediatamente esclareceu as coisas.