~/.local - ou mais precisamente, ~/.local/share - é onde os programas compatíveis com XDG armazenam dados do usuário (por exemplo, fontes, mensagens de correio) de acordo com o Especificação do Diretório Base XDG .
A pasta ~/.local também contém share/Trash , que é o seu lixeira . Tudo o que você coloca lá, claro, ocupa espaço. Presumo que esta seja a causa mais provável de uso do disco.
Verifique quanto espaço ocupa com:
du -hs ~/.local/share/Trash
Se você não precisar manter itens na lixeira, esvazie-os no gerenciador de arquivos ou exclua tudo em share/Trash com:
rm -rf ~/.local/share/Trash