Adaptando uma dessas respostas, você pode usar o VBoxManage:
VBoxManage clonehd source.vhd target.vdi --format vdi
Se você está apenas olhando para usar o vhd no Virtualbox, você não precisa convertê-lo sozinho, o Virtualbox vai usar uma imagem vhd. Você pode simplesmente adicioná-lo à lista de discos no "Virtual Media Manager".