Se você executar graphviz no modo de saída SVG, receberá um arquivo SVG, que poderá editar facilmente (por exemplo, com o Inkscape).
dot -Tsvg foo.dot > foo.svg
ou neato, ou qualquer outra coisa. -Tfig
(xfig), -Tmif
(FrameMaker) -Tps
(PostScript) e -Tdia
(dia, ferramenta de diagramação Linux / GTK) também podem funcionar, dependendo do software disponível. Uma lista completa de formatos de saída está disponível.
É claro que o ponto de graphviz é que você não tem que colocá-lo à mão ... você já viu algumas das opções do graphviz? Eles podem aliviar qualquer problema que você esteja tendo.