Parece haver um problema com o Windows Search lendo o formato do arquivo, mesmo quando definido em texto simples. É um problema conhecido e tem até foi criado aqui no Superusuário !
Minha melhor recomendação agora é usar um programa que possa pesquisar o conteúdo dos arquivos. Pode não ser tão rápido quanto tê-los indexados, mas esperamos que possa fazer o trabalho por você.
Quatro ótimas ferramentas que recomendo:
Agent Ransack (freeware):
Windows Grep :
Arquivo portátil Seeker (freeware):