Se você não tem medo da linha de comando ffmpeg é a ferramenta a ser usada.
É um pouco complicado, mas a maioria das ferramentas gratuitas é baseada no ffmpeg porque é a mais poderosa que existe. Esta é uma amostra de um comando para dividir 30 segundos de um vídeo.
ffmpeg -i input.avi -vcodec copy -ss 00:00:10:15 -t 00:00:30:00 output.avi
Se você está no Windows, é um pouco difícil de instalar, mas aqui estão alguns bons links para obtê-lo. link