Na maioria das vezes eu encontro essas pastas depois do windows update / install something. Infelizmente, não há como desativá-los de serem criados. Você pode apenas esperar que a atualização termine em OK e que a limpeza seja feita por conta própria.
Quanto à exclusão dessas pastas, você só precisa apropriar-se delas e poderá excluí-las.