Certamente não vai piorar as coisas. Existem inúmeras semelhanças entre o OS X e o Linux e, se você está começando a se interessar pelo OS X, as pequenas diferenças não serão relevantes no momento. Coisas como o bash shell, ferramentas de script e muitos aplicativos shell do Linux estão disponíveis para o OS X.
Eu desenvolvo regularmente no OS X no meu MacBook e executo meus programas em uma estação de trabalho Linux. Haverá um ponto em que você precisará aprender as diferenças entre o Linux e o OS X (por exemplo, como os serviços são gerenciados), mas quando chegar a esse ponto, você saberá onde encontrar as informações necessárias.