A única maneira de fazer isso seria parar completa e completamente o uso do Windows Explorer e usar um shell personalizado para substitua o explorador completamente. Isso significa que você não teria mais o menu Iniciar, Janelas do Explorer, etc, e teria que confiar inteiramente em algum outro software para navegar em seu sistema de arquivos. Algumas pessoas fazem isso, e há substituições disponíveis, então se você realmente quiser completamente eliminar a barra de tarefas do Windows, encontre e use uma delas de sua escolha. Já existe uma pergunta do superusuário discutindo as várias opções.
Para substituir completamente o explorer e ter seu substituto como o shell padrão que é aberto quando você efetua login, crie um valor REG_SZ
chamado Shell
in [HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon]
usando o editor de registro. Isso substituirá completamente o explorador por sua conta, tornando desnecessário o uso de qualquer técnica de ocultar / matar a barra de tarefas.