Você provavelmente deve dar uma olhada nas ferramentas relacionadas ao rsync: rdiff e rdiff-backup .
O comando rdiff
permite produzir um arquivo de correção e aplicá-lo a outro arquivo.
O comando rdiff-backup
usa essa abordagem para lidar com diretórios inteiros, mas acredito que você esteja trabalhando com imagens de disco de arquivo único, então rdiff
será o único a ser usado.