Eu tenho procurado como louco, mas não consegui encontrar alguém com um problema semelhante, então aqui vai.
Estou executando o Ubuntu 12.10 com o GNOME 3 no meu Lenovo T400. Quase uma vez a cada dia ou dois, abrirei algumas janelas e, de repente, elas desaparecerão. A única coisa que resta é o meu background com o painel superior do GNOME. (E eu acho que está um pouco acinzentado, como se algo estivesse sobreposto ao fundo).
Se eu clicar na super-chave do Windows ou clicar em "Atividades", todas elas serão exibidas, como de costume. No entanto, o menu de favoritos junto com a barra de pesquisa estará ausente. Assim que eu apertei a tecla super para retornar, as janelas desapareceram novamente, deixando-me apenas com a área de trabalho. Da mesma forma, Alt + Tab traz me mostra as diferentes janelas (como eu tenho o Coverflow instalado), mas, em seguida, nada, uma vez que eu deixo ir.
Quaisquer problemas semelhantes, sugestões, referências?
Eu não sei qual é a causa raiz, mas como solução alternativa eu sugiro que você acesse Alt+F2 (para exibir a caixa de diálogo "executar"), insira r e pressione Enter. Isso irá reiniciar o shell do Gnome, mas deixará seus aplicativos em execução.