Como o ultrasawblade disse, não deveria haver diferença, mas existe, pelo menos no período de transição.
O principal problema são servidores DNS configurados incorretamente, que podem levar uma eternidade para responder a consultas solicitando registros AAAA para sites que contêm os endereços IPv6. Esta é a razão pela qual há tantas pessoas que afirmam que a desativação do IPv6 aumentará o desempenho do navegador da web. As normas dizem que o IPv6 deve ser preferido em relação ao IPv4. Isso significa que o navegador primeiro verificará se o site é compatível com IPv6 e, se não for, irá para o IPv4. Se tudo funcionar normalmente, a verificação não deverá ser perceptível, mas alguns servidores DNS mal configurados não enviarão a resposta adequada e a conexão terá de "tempo limite". A principal razão para isso é que as pessoas geralmente são preguiçosas. Um número muito grande de pessoas não vê nenhum benefício no IPv6 e terá que ser forçado a usá-lo quando a Internet começar a estagnar devido à falta de endereços IPv4. Isso exigirá atualizações de software em servidores, roteadores e o restante do equipamento de rede ou substituição, mas o IPv6 ainda está longe e não há necessidade urgente de fazer as atualizações agora, ou é o que grande número de pessoas pensa. Isso cria o problema do ovo e da galinha porque as pessoas não usarão o IPv6 até que o equipamento IPv6 esteja disponível e os problemas sejam corrigidos e, por outro lado, os fabricantes de equipamentos não queiram prestar muita atenção ao equipamento IPv6 até que seja necessário fazê-lo. os mantenedores do servidor não querem corrigir os problemas do IPv6 até que seja necessário fazer isso.
Além disso, uma parte que às vezes é esquecida são dispositivos que não são relacionados à rede, mas usam a rede como telefones IP, scanners, impressoras e assim por diante. Eles não precisarão de suporte IPv6 imediatamente por causa do dual stack e provavelmente não terão problemas durante sua vida útil, mas alguns gerentes mal informados pensam que isso acontece e isso aumenta o custo da migração, já que todos eles teriam que ser substituídos. .
Outro ponto mencionado aqui é o NAT. Algumas pessoas se sentem seguras por trás do NAT, achando que isso aumenta a segurança. No IPv6, não é necessário. Em vez disso, os firewalls configurados corretamente devem ser usados, mas as pessoas se opõem à alteração. Houve também a conspiração "MAC". Basicamente, o endereço IPv6 é dividido em duas partes. O prefixo que vai para o roteador e o número do dispositivo conectado ao roteador. Em algumas situações, o endereço MAC pode ser usado para determinar o número do dispositivo e a história informa que isso permitirá o rastreamento de dispositivos em todas as redes. No entanto, o recurso pode ser desativado e funciona quando os primeiros 64 bits são atribuídos ao roteador e os segundos 64 bits do endereço são atribuídos aos dispositivos. O lado negativo disso é que, em alguns círculos, isso criou a desconfiança do IPv6, especialmente quando isso é combinado com a falta de NAT.