Use o xev para descobrir o código da tecla modificadora (tecla Win, neste caso).
Que seja 66.
Crie um arquivo chamado Xmodmap (ou o que você quiser) com o seguinte conteúdo.
keycode 66 = Mode_switch
keysym j = j J Left
keysym l = l L Right
keysym i = i I Up
keysym k = k K Down
Agora carregue esses mapeamentos usando xmodmap Xmodmap