O linux é mais frágil que o windows?
A resposta é: Depende .
Quando alguém diz "incapaz de inicializar" nessa situação, eu traduzo para "Corrupção do sistema de arquivos" e a resposta Sim ou Não para a pergunta original depende de qual sistema de arquivos você está usando.
O Windows não permite que você tenha toda a gama de opções para sistemas de arquivos que uma caixa do Linux permitirá. Você quase nunca vê um sistema Windows NTFS. O NTFS tem coisas embutidas para ajudá-lo se houver uma perda de energia, como registro no diário e transações de arquivo que podem reverter em caso de falha.
Uma caixa do Linux pode ter isso e não pode. Tudo depende de como o servidor foi configurado. Se o servidor usou ext2 1 você pode ser muito suscetível a corrupção de arquivos no caso de um falha de energia. Compare isso com um sistema que usou algo como Btrfs que tem mais recursos de integridade de dados do que o NTFS.
Então, se o sysadmin onde você está falando só tiver trabalhado com sistemas ext2, ele pode estar certo, mas se você usou outro sistema de arquivos, ele pode estar errado.
1: Ext2 foi o padrão para o Debian e Red Hat Linux por um longo tempo. Ele agora foi substituído principalmente pelo Ext3, que é mais parecido com o NTFS para recursos de integridade de dados.