Você pode colocar o serviço manualmente da seguinte forma:
PASSO 01) Abra o Windows CLI como Administrador
PASSO 02) cd C:\Program Files (x86)\MySQL\MySQL 5.6\bin
ou onde quer que mysqld.exe
resida
PASSO 03) Reinstale o serviço
mysqld --install
É isso.
Mencionei isso antes em ServerFault e DBA StackExchange
DÊ UMA EXPERIÊNCIA !!!