Qualquer um dos seguintes itens funcionará:
git archive --output=../_toDeploy/ArchiveName.zip master
git archive -o ../_toDeploy/ArchiveName.zip master
Para adicionar um subdiretório dentro do arquivo,
git archive --output=../_toDeploy/ArchiveName.zip --prefix=MyStuff/ master
Consulte a página de manual do git-archive para referência.