Tente digitar na barra de endereço:
cmd /c notepad foo.txt
Isso abre o arquivo foo.txt no local atual da janela do Explorer. Quando o que você executa termina ou é fechado, o console do CMD é fechado.
Eu notei que posso executar qualquer coisa no meu caminho fazendo isso - até scripts em lote. Uma descoberta muito legal eu acho!
Eu não uso o Mercurial, então não posso dizer se ele faria o que você quer, mas acho que será.