Verifique se você está usando uma porta USB2.0 e verifique se o controlador USB 2.0 diz "alta velocidade" - muitos fabricantes desonestos vendem os dispositivos USB "full speed (12)" com um etiqueta proeminente "USB 2.0", que é tecnicamente precisa, mas engana as pessoas que acham que o USB 2.0 implica "Alta velocidade".
Verifique também se o seu disco rígido USB tem a opção de montagem " sync " ativada? Esta é outra causa de desaceleração. Você pode remontar o sistema de arquivos com
mount -o remount,async... /dev/usbdisk ...