Se o Ubuntu ainda estiver usando o Alsa para seu mecanismo de som (não sei como já faz algum tempo desde que eu usei), você pode reiniciar digitando sudo /etc/init.d/alsa-utils restart
no terminal.
Como não parece estar funcionando, talvez seja necessário certificar-se de que nada esteja tentando usá-lo. (exemplo descaradamente roubado de os fóruns do Ubuntu )
name@comp:~$ lsof | grep pcm
sh 5079 name 70u CHR 116,6 13639 /dev/snd/pcmC0D0p
name@comp:~$ kill -9 5079