Normalmente, ambas as extremidades negociariam apenas a maior velocidade disponível.
Mas se você tiver autonegotiation desativado, mas o switch espera que ele seja ativado, você ficará preso a um conexão half-duplex de 100 Mbps muito confiável.
Parallel detection is used when a device that is capable of autonegotiation is connected to one that is not. This happens if the other device does not support autonegotiation or autonegotiation is administratively disabled. In this condition, the device that is capable of autonegotiation can determine and match speed with the other device. This procedure cannot determine the presence of full duplex, so half duplex is always assumed [by the autonegotiating switch].
O que leva a ...
The end result is a connection that is working but performs extremely poorly because of the duplex mismatch. Symptoms of a duplex mismatch are connections that seem to work fine with a ping command, but "lock up" easily with very low throughput on data transfers; the effective data transfer rate is likely to be asymmetrical, performing much worse in one direction than the other.
Em ambos os casos, outros dispositivos conectados ao mesmo switch não serão afetados, já que cada porta de um switch é configurável separadamente (diferentemente dos hubs, que apenas conectam todas as portas a uma grande rede).
Veja a autonegociação e Incompatibilidade duplex na Wikipedia.
Pessoalmente, acho que desabilitar a negociação automática causa mais problemas do que ganhos. Economizar um pouquinho de bateria é importante quando você desperdiça mais fazendo com que as transferências demorem dez vezes mais, e ainda mais quando a conexão incompatível realmente é ruim?