Basta criar um iniciador em sua área de trabalho.
Clique com o botão direito do mouse em sua área de trabalho - > Clique em Criar iniciador
Ele trará uma janela. No campo de nome, você pode escrever o nome que desejar. No campo de comando, digite mono /path/to/the/MYPROGRAM.exe
sem aspas.
Agora você pode clicar neste atalho para iniciar seu programa.