O MDWiki pode atender às suas necessidades.
MDwiki is a CMS/Wiki completely built in HTML5/Javascript and runs 100% on the client. No special software installation or server side processing is required. Just upload the mdwiki.html shipped with MDwiki into the same directory as your markdown files and you are good to go!
Está em desenvolvimento ativo e parece valer a pena. Ele não tem (parece) ter qualquer indexação automática, mas outro que está atendendo às minhas necessidades.