Você pode ter vários prefixo de vinho em sua máquina, cada um sendo executado como um vinho separado. Então você pode criar um prefixo de 32 bits e instalar o dotnet2 nele:
Isto irá criar um novo wineprefix (.wine32 em sua casa) e configurá-lo como 32 bits:
WINEARCH=win32 WINEPREFIX=~/.wine32 winecfg
Você pode usá-lo dessa forma combinado com winetricks para configurar o WINEARCH, criar o prefixo e instalar o dotnet 2.0 em um comando:
env WINEARCH=win32 WINEPREFIX=~/.wine32 winetricks dotnet20
ou apenas:
env WINEPREFIX=~/.wine32 winetricks dotnet20
se você já definiu a WINEARCH e criou o WINEPREFIX com o primeiro comando acima.