A velha novidade: Por que posso instalar o Windows na minha unidade USB? (15 de abril de 2004)
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Another reason not mentioned in this paper is that during any hot-plug operation, the USB bus is completely reinitialized. Windows really doesn't like it when it loses access to its boot device.[/...]
O whitepaper mencionado aqui é Recomendações para inicializar o Windows a partir de dispositivos de armazenamento USB .
Possivelmente relacionado: Um mergulho profundo na inicialização do USB (MSDN)