Por este site e este site, os sinalizadores de linha de comando conhecidos para o Skype são:
-
/callto [Skype user or telephone number]
- chama um usuário ou número do Skype -
/datapath [path]
- Especifica onde os dados pessoais do usuário devem ser armazenados pelo Skype -
/nosplash
- Impede que a tela inicial do Skype exiba -
/minimized
- Inicia o Skype minimizado na bandeja do sistema -
/removable
- Garante que caminhos inexistentes não sejam gravados no registro do Windows e que outros serviços de manutenção para executar o Skype a partir de mídia removível -
/shutdown
- Pára uma instância do Skype em execução
Eu acredito que pode haver mais, mas isso é tudo que pude encontrar.