Ainda estou muito interessado em responder à minha primeira pergunta, mas a respeito da minha segunda questão , descobri que as tags são salvas no arquivo "prefs.js", que é na pasta de perfil do Thunderbird. Exemplo para a tag "Importante":
user_pref("mailnews.tags.$label1.color", "#FF0000");
user_pref("mailnews.tags.$label1.tag", "Important");
(Tags definidas pelo usuário também são encontradas nesse arquivo; não apenas tags predefinidas.)
Portanto, salvar este arquivo é provavelmente uma boa maneira de fazer um backup das tags que foram definidas no Thunderbird. Quanto a restaurar essas tags em outro perfil, eu não testei , mas talvez simplesmente copiando essas linhas no arquivo (quando TB não está rodando) faria o truque.