Se alguém ainda estiver interessado nisso, a versão atual do VLC é capaz de fazer isso muito bem sem qualquer tipo de script ou complemento. Para realizar isso, basta abrir o VLC e selecionar Media > Open Multiple Files. Dentro das janelas de arquivos múltiplos, selecione adicionar para adicionar o primeiro arquivo. Depois disso, clique na caixa de seleção "Mostrar mais opções" e na caixa de seleção "Reproduzir outra mídia sincronicamente" na parte inferior da janela. Selecione procurar ao lado de "Mídia extra" para adicionar o segundo arquivo. Hit play e os dois arquivos de mídia serão reproduzidos simultaneamente com uma única janela de controle.