Eu recomendo Fast Stone Capture , ele tem várias opções de captura, como tela cheia, janela inteira (somente a janela que você escolha, mesmo que não seja fullscreeen), região retangular (que é o que você quer), e até região livre e janela de rolagem, que é a minha favorita, pode Capture automaticamente qualquer janela de rolagem na maioria dos programas, mesmo que tenha rolagem vertical e horizontal. Isso é especialmente útil para páginas da Web ou janelas de diálogo. Outras ferramentas não têm essa opção e você teria que fazer várias capturas de tela e depois "colá-las" juntas por você mesmo.
Além disso, você pode acionar a captura através de uma pequena janela flutuante ou através de atalhos de teclado configuráveis, e também pode copiar a imagem diretamente para a área de transferência ou para um editor embutido (muito bom) ou diretamente para um arquivo , quer pedindo um nome, ou automaticamente nomeá-lo com várias opções, como data, hora, etc.
A versão atual é paga, mas várias versões anteriores, era completamente grátis, então você pode procurar a última versão freeware (era a versão 5.3) e usá-la sem problemas, funciona muito bem! É claro que as novas atualizações pagas têm outros recursos interessantes, então é sua ligação. Ou eu acho que você pode tentar a versão mais recente por um período de teste (não tenho certeza). Basta verificar o site deles para mais informações.
Espero que ajude!