Embora eu não possa dizer com certeza, parece que algum instalador de aplicativos estava usando a raiz da unidade para um local temporário, em vez do mais lógico C: \ tmp (ou algum nome semelhante). Este instalador esqueceu de apagar seus arquivos temporários ou foi interrompido no meio da instalação. Excluindo os arquivos deve ser bom (e no Linux seria feito automaticamente na reinicialização, eu poderia adicionar); Eu tentaria fazer login como administrador para contornar o problema de permissões.
Resposta a editar: tente mover a pasta para um local diferente (pontos de bônus para ir para uma unidade removível e desconectá-la), reinicializar e testar várias coisas. Se tudo correr bem, excluí-lo não poderá prejudicar nada. Caso contrário, mova a pasta de volta ao local original.