Eu prefiro muito mais manter os arquivos na mesma instância do excel. Há vários recursos que não funcionam entre arquivos se você abrir em instâncias diferentes (como na resposta de Ivo). Outra maneira de conseguir isso é abrir os 2 arquivos na mesma janela do Excel e, em seguida, vá para Visualizar > Organize Tudo, selecione Vertical e pressione OK. Mesma janela do Excel, mas agora pode visualizar 2 arquivos de uma só vez.
Você pode até ver duas folhas do mesmo arquivo dessa maneira. A única diferença é que primeiro você deve selecionar Visualizar > Nova janela.
Há momentos em que eu uso o método de Ivo. Principalmente quando tenho arquivos com macros que preciso testar ou comparar com outras versões. Acho melhor separar as instâncias e os processos.