Na minha pergunta acima, afirmei que a BIOS viu os 6GB. Eu disse isso porque ao inicializar, como mostrou as informações do dispositivo etc antes de inicializar, ele listou 6 GB de RAM.
John sugeriu que eu procurasse uma configuração para a HPET e, ao fazê-lo, descobri que a configuração do BIOS relatava que a única quantidade utilizável de memória do sistema era algo como 4,3 GB.
Isso obviamente mostra que não foi um problema do Ubuntu (gostaria de ter encontrado isso antes!) e substituir um dos 2GB para 2x 1GB me dá os 6GB que eu estava procurando.
Minha configuração de memória anterior era:
DIMM0: 2GB DDR2
DIMM1: 2GB DDR2
DIMM2: 2GB DDR2
DIMM3: EMPTY
Minha configuração agora é:
DIMM0: 2GB DDR2
DIMM1: 1GB DDR2
DIMM2: 2GB DDR2
DIMM3: 1GB DDR2
Isso só aconteceu porque eu tive que remover um pau defeituoso! Mas pelo menos é classificado agora!