Normalmente, há uma configuração de BIOS / CMOS para selecionar a funcionalidade padrão dessas chaves.
Verifique se há uma opção que escolha teclas-F ou funções, algo assim.
Realmente esse é o único lugar para procurar, já que as teclas digitadas no Fn-Fx são interpretadas pelo hardware muito antes de o sistema operacional ver a entrada. Em algumas máquinas mais antigas, havia um applet do painel de controle que girava os bits nas configurações do CMOS para alterar as coisas. Icky.