Update: Seems like Thunderbird changed the keyboard shortcut from Ctrl+L to Ctrl+K
Eu sei que já faz meses desde que você postou a pergunta, mas há uma maneira simples de fazer isso. Digite seu texto, pressione Ctrl + K insira o link e continue digitando.
Eu testei o jeito que você faz e repliquei e posso dizer que é frustrante, mas uma solução simples é digitar o seu email como você faz normalmente, antes de você querer digitar um link pressione Ctrl + K , que irá aparecer uma janela com o texto de exibição e hiperlink, pressione OK e continue digitando como se nada tivesse mudado.