Em vez de abrir várias janelas e estabelecer várias sessões ssh (na mesma máquina?), dê uma olhada na tela. Você pode ssh para um host, iniciar a tela e a partir daí abrir vários consoles virtuais, um para cada comando que você deseja executar.
O que é realmente bom na tela, é que se você perder a conexão ssh, você pode criar uma nova e se reconectar às sessões da tela de execução. É muito legal. Há também o tmux, que é um programa similar (não tenho certeza de como está disponível em diferentes Linuxes.
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