Você pode inicializar seu computador com um LiveCD com um pouco de sabor do Linux e depois conectar o dispositivo USB. Qualquer infecção potencial provavelmente não infectaria seu sistema. Um passo adicional seria desconectar seu disco rígido primeiro, ENTÃO inicializar o LiveCD. Desconectar a unidade primeiro garantiria que qualquer infecção potencial não atingisse sua instalação sensível do sistema operacional. Se houvesse algo no pendrive, e ele pudesse infectar a versão do Linux que você inicializasse, então desligar o computador removeria o sistema operacional temporário do Ram e você ficaria limpo.
Isso pode parecer excessivamente paranóico, mas se você está realmente preocupado, e não está necessariamente confiante de que sua suíte de antivírus pode lidar com possíveis infecções que possam estar presentes, este método leva apenas alguns minutos para se preparar. e nenhuma instalação.