Eu percebo que este post tem dois anos, mas eu achei que poderia ajudar alguém tentando fazer uma pesquisa como eu estava enquanto encontrava o mesmo problema na noite passada.
Para ser claro, eu estava tendo o mesmo problema ao tentar formatar e reinstalar o Win 7 Ultimate na máquina personalizada que criei há alguns anos.
Não permitiria que eu fizesse alterações na partição em que o Windows estava instalado. Não consegui formatar ou eliminar. Literalmente não tinha opções além de instalar o Windows novamente e ter a pasta "janelas antigas" criada. O problema parecia ser que, apesar da inicialização do DVD do Win 7, em algum nível a partição com o Win 7 estava sendo acessada e, portanto, não me permitia avançar.
Eu inicializei a partir do DVD do Win 7 e entrei no modo de recuperação do Windows. Então eu abri o prompt do cmd. De lá eu localizei e deletei a pasta do Windows dentro do DOS. O diretório ainda existia no disco rígido, mas não pôde ser visto. Então eu era capaz de desmontar e formatar a unidade enquanto ainda no prompt de comando. Depois disso, reiniciei e recarreguei o DVD do Win 7 e consegui remontar a partição e instalar o Win 7.
A única desvantagem de fazer isso foi reorganizar os rótulos dos meus drives D, E e F existentes. Fora isso, funcionou perfeitamente.