Verifique o valor da variável de ambiente TERM
, o comportamento do terminal do Vim é definido por isso.
env | grep TERM
Verifique se está definido como cygwin
para que o vim funcione corretamente com o ConEmu.
NB Isso também se aplica no Bash, onde eu tive um erro de redesenho similar quando TERM foi incorretamente configurado para xterm
.